用RACE技术对一株肠道病毒3'端进行扩增和序列分析
摘要:
目的 应用3'RACE技术对一株本室分离肠道病毒基因组3'末端进行扩增,并对其核苷酸序列进行比较分析.方法 提取病毒总RNA,以锚定oligdT(17)引物进行逆转录,用特异引物及锚定引物进行3'RACE扩增,将PCR产物进行克隆、测序和序列分析.结果 获得了该病毒的3'端核苷酸序列,同源性分析结果显示该肠道病毒的核苷酸序列与肠道病毒76、89、90、91型的同源性最高为90%左右,而与其他型别的肠道病毒的同源性均小于80%;推导的氨基酸同源性与肠道病毒76、89、90、91型均在90%以上.结论 用RACE技术对肠道病毒3'端进行扩增及序列分析,证明该病毒属新型肠道病毒类,为进一步研究该病毒的分子生物学特性奠定了基础.
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doi:
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关键词:
肠道病毒属
DNA
序列分析
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Keyword:
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作者:
侯俊
沈宏辉
胡燕
朱雷
王志杰
雷厉
貌盼勇
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Author:
HOU Jun
SHENG Hong-hui
HU Yan
ZHU Lei
WANG Zhi-jie
LEI Li
MAO Pan-yong
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作者单位:
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刊名:
中华实验和临床病毒学杂志
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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