用RACE技术对一株肠道病毒3'端进行扩增和序列分析

摘要:

目的 应用3'RACE技术对一株本室分离肠道病毒基因组3'末端进行扩增,并对其核苷酸序列进行比较分析.方法 提取病毒总RNA,以锚定oligdT(17)引物进行逆转录,用特异引物及锚定引物进行3'RACE扩增,将PCR产物进行克隆、测序和序列分析.结果 获得了该病毒的3'端核苷酸序列,同源性分析结果显示该肠道病毒的核苷酸序列与肠道病毒76、89、90、91型的同源性最高为90%左右,而与其他型别的肠道病毒的同源性均小于80%;推导的氨基酸同源性与肠道病毒76、89、90、91型均在90%以上.结论 用RACE技术对肠道病毒3'端进行扩增及序列分析,证明该病毒属新型肠道病毒类,为进一步研究该病毒的分子生物学特性奠定了基础.

Abstract:

  • doi:
  • 关键词: 肠道病毒属 DNA 序列分析
  • Keyword:
  • 作者: 侯俊 沈宏辉 胡燕 朱雷 王志杰 雷厉 貌盼勇
  • Author: HOU Jun SHENG Hong-hui HU Yan ZHU Lei WANG Zhi-jie LEI Li MAO Pan-yong
  • 作者单位:
  • 刊名: 中华实验和临床病毒学杂志
  • Journal:
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