罂粟属植物核心DNA条形码的筛选
摘要：
DNA条形码(DNA barcoding)技术是一种准确、高效且对操作人员要求不高的物种鉴定技术.为了筛选出适合罂粟属的DNA条形码,从GenBank上获得罂粟属植物共69条序列,包括21条ITS序列,10条matK序列,8条psbA-trnH序列,14条rbcL序列和16条trnL-trnF序列.应用Mega 6.0软件分析了罂粟属的ITS,matK,psbA-trnH,rbcL,trnL-trnF序列的特征,通过计算序列的种内、种间距离,评估序列的Barcoding Gap和构建NJ,UPGMA系统发育树进行分析.分析结果表明:trnL-trnF不仅种内变异和种间变异差别最大,而且有明显的barcoding gap,种内变异和种间变异重合较少,能较好地区分不同种类的罂粟;所构建的NJ和UPGMA系统发育树,也能将全部物种区分开.综合考虑,建议把trnL-trnF作为鉴定罂粟属植物的核心条形码,结合其他片段作为组合条形码.
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doi：
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关键词：
DNA barcoding
罂粟属
ITS
matK
psbA-trnH
rbcL
trnL-trnF
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Keyword：
DNA barcoding
Papaver
ITS
matK
psbA-trnH
rbcL
trnL-trnF
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作者：
张爽
刘宇婧
吴沿胜
曹颖
袁媛
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Author：
ZHANG Shuang
LIU Yu-jing
WU Yan-sheng
CAO Ying
YUAN Yuan
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作者单位：
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刊名：
中国中药杂志
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Journal：
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年，卷(期)：
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所属期刊栏目：
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基金项目
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在线出版日期：
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页码：