龙岩市一起暴发性脑炎疫情分离的埃可病毒6型基因特征分析
摘要:
对2010年福建省龙岩市长汀县埃可病毒6型(ECHO6)肠道病毒引起的暴发性脑炎,进行病原学分析,为该病的防控提供有价值的信息.对病例脑脊液标本进行荧光RT-PCR、病毒分离(RD细胞)、中和鉴定进行病原确认,再经PCR法对其中4株毒株进行VP1片段或全基因组核苷酸序列测定,用DNAStar软件中的MegAlign等软件进行同源性分析,Mega 4.0软件进行进化树分析.经病原学检测方法确认为ECHO6型肠道病毒,VP1片段核苷酸序列分析显示为C2亚型.全基因组序列共7 407个核苷酸,与其他ECHO病毒和CVB(Coxsackie virus B)病毒基因组构成相似,同源性为78.5%~87.3%.此次暴发性脑炎是由肠道病毒ECHO6 C2亚型引起,病毒株全基因组序列长度与标准株(U16283)相近,同源性达80.4%.
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doi:
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关键词:
脑脊液
ECHO 6
肠道病毒
脑炎
RT-PCR
核苷酸序列
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Keyword:
Cerebrospinal fluid
ECHO 6
Enterovirus
Encephalitis
RT-PCR
Nucleotide sequence
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作者:
曹春远
陈前进
何春荣
罗招福
何云
廖亦红
吴水新
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Author:
CAO Chun-yuan
CHEN Qian-jin
HE Chun-rong
LUO Zhao-fu
HE Yun
LIAO Yi-hong
WU Shui-xin
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作者单位:
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刊名:
病毒学报
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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