中国宿主动物中Amur汉坦病毒M片段全基因序列分析
摘要：
目的 测定中国宿主动物中Amur病毒M片段全基因序列,以了解其分子特征.方法 设计特异的PCR引物,用RT-PCR法分段扩增JilinAP06株M片段全长,PCR产物经克隆后进行序列测定,然后进行系统发育分析和重组分析.结果 JilinAP06株M片段全基因序列共3615个核苷酸,A+T含量为59.3%,G+C含量为40.7%,包含1个单一的开放读码框架,其最大读码框架从41～3448,由3408个核苷酸组成,共编码1135个氨基酸.序列同源分析表明,JilinAP06株与中国的人源Amur HV株同源性为96.0%～97.8%,与韩国大林姬鼠来源的Soochong HV同源性为85.6%～86.7%,与HTNV原型株76-118同源性仅为79.5%,而与其他各型病毒间的同源性均低于79.0%.氨基酸同源分析,其氨基酸序列与中国的人源株Amur HV同源性为98.1%～98.4%,与韩国大林姬鼠来源的Soochong HV同源性为96.4%～97.0%,与HTNV原型株76-118同源性为91.7%,而与其他各型病毒间的同源性均低于92.0%.系统发育分析结果显示,JilinAP06与Amur病毒构成一个相对独立的分支.结论 从中国宿主动物中获得了AmurHV的M片段全基因序列.
-
doi：
-
关键词：
汉坦病毒
Amur病毒
M片段
序列分析
-
Keyword：
Hantavirus
Amur virus
M segment
Sequence analysis
-
作者：
郭卫东
张文义
江佳富
池海谊
王文瑞
王中元
金鹰
杨红
方立群
曹务春
-
Author：
GUO Wei-dong
ZHANG Wen-yi
JIANG Jia-fu
CHI Hai-yi
WANG Wen-rui
WANG Zhong-yuan
JIN Ying
YANG Hong
FANG Li-qun
CAO Wu-chun
-
作者单位：
-
刊名：
中华流行病学杂志
-
Journal：
-
年，卷(期)：
-
所属期刊栏目：
-
基金项目
-
在线出版日期：
-
页码：