内转录间隔区(ITS)序列分析技术对丝状真菌临床分离株鉴定能力的评估

摘要:

目的 评价内转录间隔区(ITS)序列分析技术对丝状真菌临床分离株的鉴定能力.方法 对267株丝状真菌临床分离株进行ITS序列测定,经与GenBank联合MycoBank数据库进行序列同源性比对获得其菌种信息. 结果 全部菌株均成功获得ITS序列.ITS可将53.9% (144/267)受试丝状真菌鉴定至种水平,44.2% (118/267) 鉴定至属水平,5株菌因其ITS序列在不同菌属间均有>95%相似度而无法鉴定.结论 ITS序列分析技术对丝状真菌临床分离株鉴定能力尚可,但因其通用性良好可作为丝状真菌属水平鉴定的优先检测基因.对于进一步的种水平鉴定,则应结合具体情况选用其他功能性基因片段.

Abstract:

  • doi:
  • 关键词: 内转录间隔区(ITS) 序列分析 丝状真菌 鉴定
  • Keyword: ITS Sequencing analysis Filamentous fungi Identification
  • 作者: 李颖 郭莉娜 徐英春
  • Author: Li Ying Guo Lina Xu Yingchun
  • 作者单位:
  • 刊名: 中华微生物学和免疫学杂志
  • Journal:
  • 年,卷(期):
  • 所属期刊栏目:
  • 基金项目
  • 在线出版日期:
  • 页码:
相同研究主题
相关论文(与本文研究主题相同或者相近的论文)
Copyright © 2014-2019 晟斯医学 All Rights Reserved. 备案号:苏ICP备11037034号-5 版权所有:南京孜文信息咨询有限公司