内转录间隔区(ITS)序列分析技术对丝状真菌临床分离株鉴定能力的评估
摘要:
目的 评价内转录间隔区(ITS)序列分析技术对丝状真菌临床分离株的鉴定能力.方法 对267株丝状真菌临床分离株进行ITS序列测定,经与GenBank联合MycoBank数据库进行序列同源性比对获得其菌种信息. 结果 全部菌株均成功获得ITS序列.ITS可将53.9% (144/267)受试丝状真菌鉴定至种水平,44.2% (118/267) 鉴定至属水平,5株菌因其ITS序列在不同菌属间均有>95%相似度而无法鉴定.结论 ITS序列分析技术对丝状真菌临床分离株鉴定能力尚可,但因其通用性良好可作为丝状真菌属水平鉴定的优先检测基因.对于进一步的种水平鉴定,则应结合具体情况选用其他功能性基因片段.
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doi:
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关键词:
内转录间隔区(ITS)
序列分析
丝状真菌
鉴定
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Keyword:
ITS
Sequencing analysis
Filamentous fungi
Identification
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作者:
李颖
郭莉娜
徐英春
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Author:
Li Ying
Guo Lina
Xu Yingchun
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作者单位:
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刊名:
中华微生物学和免疫学杂志
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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