人类免疫缺陷病毒-1 CRF01 AE 毒株在我国的分子传播网络分析
摘要：
目的：构建我国 HIV-1 CRF01 AE 毒株分子传播网络，并分析网络特征。方法从洛斯阿拉莫斯国家实验室 HIV 基因数据库（Los Alamos database）下载中国地区的 CRF01 AE pol 区基因序列并进行人口学信息核对。通过构建系统进化树、提取传播簇、最小基因距离选择及传播网络可视化4个步骤构建传播网络。运用卡方检验分析不同人群参与网络形成的比例和网络中度的分布。描述性分析不同人群和不同地区之间的传播关联。结果2419条序列共形成250个大小介于2~25的传播网络，包括847个节点和610条边。度≥2的个体虽然只占网络中个体总数的26.4%（224/847），但与66.5%（563/847）的个体存在关联。男男同性性行为者（ MSM）、男性异性性行为者、静脉药瘾者（IDUs）及女性异性性行为者参与网络形成的比例分别为37.6%（669/1781）、28.4%（102/359）、16.1%（10/62）和30.4%（66/217），差异有统计学意义（χ2=23.774，P﹤0.001）。MSM 人群中度≥2的比例（10.8%，193/1781）显著高于男性异性性行为者（5.6%，20/359）和女性异性性行为者（4.6%，10/217）（P 值分别为0.002和0.004）。网络中绝大多数（95.5%，639/669）MSM 与其他MSM 之间存在传播关联，仅有2.4%（16/669）的个体与女性异性性行为者之间存在传播关联，但有15.1%（10/66）的女性异性性行为者与 MSM 之间存在传播关联。男性异性性行为者与女性异性性行为者之间存在传播关联的比例为35.3%（36/102），与 MSM 之间具有传播关联的比例为9.8%（10/102）。网络中20.9%（177/847）的个体与其他省份之间存在传播关联。结论较少比例的超级传播者在 CRF01 AE 毒株的分子传播网络形成中起到了核心作用，不同人群和不同地区之间的毒株进行着活跃的传播。
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doi：
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关键词：
CRF01AE毒株
分子流行病学
传播网络
传播簇
系统进化分析
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Keyword：
CRF01 AE strain
Molecular epidemiology
Transmission network
Transmission cluster
Phylogenetic analysis
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作者：
李小杉
钟平
李伟
杜国平
方坤
宋玥
朱可心
郭艳
高蓉
颜文娟
宣杨
卫平民
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Author：
Li Xiaoshan
Zhong Ping
Li Wei
Du Guoping
Fang Kun
Song Yue
Zhu Kexin
Guo Yan
Gao Rong
Yan Wenjuan
Xuan Yang
Wei Pingmin
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作者单位：
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刊名：
中华微生物学和免疫学杂志
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Journal：
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年，卷(期)：
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所属期刊栏目：
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基金项目
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在线出版日期：
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页码：