中国人群新等位基因HLA-B*40:74的序列分析及认定
摘要:
目的 序列分析及认定1例中国人群HLA新等位基因.方法 应用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes,PCRSSOP)基因分型方法和基于测序的分型方法(sequencing-based typing,SBT),通过软件分析该基因序列及与最相近等位基因序列的差异.结果 PCR-SSOP结果显示,该样本HLA-B位点反应格局出现异常提示;测序结果最终表明其B位点第2外显子序列与所有已知HLA-B等位基因序列均不一致,与序列最相近的等位基因B* 40:01:01,在所检测的第2、3、4外显子中的差异只是在第2外显子发生了nt103G→T,nt106A→G两个核苷酸替代,并导致相应的第35位密码子由A(丙氨酸)→S(丝氨酸),第36位密码子由M(蛋氨酸)→V(缬氨酸).结论 该基因为HLA-B新等位基因,被世界卫生组织HLA因子专用术语命名委员会正式命名为HLA-B* 40:74( HWS10004518-EF458488).
-
doi:
-
关键词:
等位基因
HLA-B*40:74
序列分析
-
Keyword:
Allele
HLA-B * 40∶74
Sequencing-based typing
-
作者:
李晓丰
章旭
张坤莲
陈阳
刘显智
李剑平
-
Author:
LI Xiao-feng
ZHANG Xu
ZHANG Kun-lian
CHEN Yang
LIU Xian-zhi
LI Jian-ping
-
作者单位:
-
刊名:
中华微生物学和免疫学杂志
-
Journal:
-
年,卷(期):
-
所属期刊栏目:
-
基金项目
-
在线出版日期:
-
页码: