白纹伊蚊感染登革病毒后病毒特异性piRNAs分析
摘要:
目的 筛选并分析白纹伊蚊感染登革病毒后病毒特异性vsRNAs与vpiRNAs.方法 白纹伊蚊羽化后2~4d雌性成蚊显微注射DENV-2病毒NGC株,对照组注射生理盐水.8d后提取样品总RNA,分离小RNA,通过illumina Hiseq 2000测序仪进行测序分析.以SOAP2软件与DENV-2基因组和互补序列进行比对.对病毒特异性的vsRNAs与vpiRNAs的长度、碱基与链偏好性、基因组分布进行分析.结果 对于感染蚊虫,我们共计获得3835个特异的DENV-2来源的vsRNAs,其中395个特异性的vpiRNAs.94.99% vpiRNAs主要来源于病毒的正链基因组.vpiRNAs在DENV-2基因组上的分布也具有偏向性,最高峰位于病毒非结构蛋白NS5编码区域的3'末端.第10位碱基具有较强的腺嘌呤偏好性,但第1位碱基不具有尿嘧啶偏好性;也无典型“乒乓”扩增循环的特征.结论 白纹伊蚊感染登革病毒后,体内出现病毒特异性vsRNAs与vpiRNAs,对其鉴定与分析将为在白纹伊蚊抗病毒免疫研究提供理论基础.
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doi:
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关键词:
登革热病毒
伊蚊属
RNA
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Keyword:
Dengue virus
Aedes
RNA
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作者:
赖植发
王衍海
顾金保
陈晓光
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Author:
Lai Zhifa
Wang Yanhai
Gu Jinbao
Chen Xiaoguang
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作者单位:
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刊名:
中华实验和临床病毒学杂志
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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