人博卡病毒1型的近似全基因组扩增及HBoV1-4重组分析
摘要：
目的 扩增人博卡病毒1型的近似全基因组序列,分析HBoV1-4之间的基因重组关系.方法 以检出HBoV1单阳性的鼻咽抽吸物为原始标本,采用PCR的方法扩增HBoV1的5个片段并测序,Blast比对确定是HBoV1片段后用DNAMAN进行序列拼接,拼接序列与已提交的近似全基因组的HBoV1在不同编码区进行同源性分析,并构建进化树；对HBoV1-4的不同编码区进行序列比对和进化分析,揭示HBoV1-4间的基因重组.结果 得到近似全长为5287 bp的HBoV1-NC序列,同源性分析发现HBoV1-NC与重庆株进化关系最近,与广州株进化距离最远；HBoV3可能由HBoV1和HBoV4重组进化而来,HBoV4可能由HBoV2与HBoV3重组进化而来.结论 本研究成功获得近似全基因组的HBoV-NC,HBoV1-4间存在着基因重组关系.
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doi：
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关键词：
博卡病毒
人
种系发生
重组
遗传
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Keyword：
Bocavirus
human
Phylogeny
Recombination
genetic
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作者：
崔换弟
金玉
谢广成
程卫霞
章青
段招军
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Author：
Cui Huandi
Jin Yu
Xie Guangcheng
Cheng Weixia
Zhang Qing
Duan Zhaojun
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作者单位：
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刊名：
中华实验和临床病毒学杂志
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Journal：
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年，卷(期)：
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所属期刊栏目：
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基金项目
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在线出版日期：
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页码：