2015-2016年贵州省柯萨奇病毒A6型分离株的基因特征分析
摘要:
目的 分析贵州省柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CVA6)分离株的基因特征. 方法 2015-2016年分离自贵州省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)患者的5株CVA6,采用RT-PCR进行VP1区基因扩增并测序,通过MEGA7.0软件采用邻位相接法(neighbor joining method)构建遗传进化树,分析VP1区基因特征,通过1000bootstrap值评估其可靠性. 结果 5株CVA6贵州分离株之间的的核苷酸与氨基酸同源性分别为94.2%~100%和97.3%~100%,与原型株Gdula株之间的核苷酸同源性与氨基酸分别为81.8%~83.1%,和94.5%~95.7%;5株CVA6均为F基因型,其中1株(MF45512)为F2基因亚型,另外4株为F3基因亚型. 结论 2015-2016年贵州省CVA6流行株为F2和F3基因亚型,以F3基因亚型为主.
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doi:
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关键词:
柯萨奇病毒A6
进化分析
基因特征
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Keyword:
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作者:
王宇
任刚
苏飞
王寅寅
王涛
叶绪芳
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Author:
WANG Yu
REN Gang
SU Fei
WANG Yin-yin
WANG Tao
YE Xu-fang
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作者单位:
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刊名:
中国病原生物学杂志
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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