ChIP-seq比较分析人体心脏和脾脏的H3K9三甲基化差异
摘要：
目的 分析人体器官心脏和脾脏的H3K9me3的全基因图谱,以期发现H3K9三甲基化的修饰与组织特异性的表达、功能和发育具有相关性.方法 通过染色质免疫共沉淀的方法获取各标本DNA,通过qPCR验证ChIP结果,然后构建ChIP Sequencing文库,与目的基因组序列比对,获取比对Reads,接着进行全基因组的Peak分析,GO功能富集分析peak相关基因的生物学功能.结果 心脏和脾脏间有169个基因有显著地H3 K9me3差异,其中心脏中H3 K9me3的基因中有64个特殊基因,脾脏中H3 K9 me3的基因中有87个特殊基因.从这些基因中,挑选出8个表现H3K9 me3明显的基因,然后再从这8个基因中挑选出两个心脏和脾脏间表现H3K9 me3差异最明显的基因,分别是PTPN3和RBMS.结论 H3K9 me3差异可作为一个潜在的生物标志物或是表观遗传疾病的治疗靶点.
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doi：
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关键词：
H3K9me3
ChIP-seq
表观遗传学
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Keyword：
H3K9me3
ChIP-seq
epigenetic
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作者：
薛雯
曹翠辉
眭维国
车文体
陈洁晶
郭丽
戴勇
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Author：
XUE Wen
CAO Cui-hui
SUI Wei-guo
CHE Wen-ti
CHEN Jie-jing
GUO Li
DAI Yong
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作者单位：
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刊名：
基础医学与临床
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Journal：
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年，卷(期)：
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所属期刊栏目：
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基金项目
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在线出版日期：
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