单核苷酸多态性JSON文件的转换

摘要:

目的 对SNP原始文本格式转换成规范JSON格式,便于计算机软件分析人类的基因.方法 利用Node.js流函数pipe对庞大的SNP原始文本文件进行分段读取进内存并转换成规范的JSON格式,最后分段地写入到一个最终结果文件中去.结果 针对不同基因测序厂商提供的检测结果,提供了一种相对规范的JSON格式,开发出了转换工具包.结论 采用JSON文件格式可以较好、较简单地对多厂商的SNP原始文本文件进行规范的表达,使用Node.js开发的转换工具效率较高.

Abstract:

  • doi:
  • 关键词: 单核苷酸多态性 JSON Node.js 文件转换
  • Keyword: single nucleotide polymorphism JSON Node.js file conversion
  • 作者: 王潘章
  • Author: WANG Panzhang
  • 作者单位:
  • 刊名: 北京生物医学工程
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