高危型人乳头瘤病毒(HR-HPV) E6癌蛋白在宫颈癌发生发展中起重要作用.本研究旨在评估一种新型、快速、低成本的HPV E6癌蛋白检测技术(OncoE6TM,AVC,Sunnyvale,CA,USA)在棉签和液基细胞学(Liquid-based cytology,ThinPrep(R))两种不同采样和储存介质宫颈标本中对HPV E6癌蛋白检测结果的一致性和对宫颈上皮内瘤变2/3(CIN2/3)及以上病变检出准确性.依托于1999年在山西省建立的宫颈癌筛查队列,对2014年随访中HPV DNA检测(第二代杂交捕获技术,HC2)阳性妇女的棉签和ThinPrep(R)标本均进行E6癌蛋白检测,并用线性反向探针杂交技术(LiPA,Innogenetics)进行HPV基因分型.在294例HPV阳性妇女的棉签和ThinPrep标本中,E6癌蛋白阳性率相当(11.2％ vs 7.8％,P=0.16);两者一致率为96.6％、Kappa值0.8.E6癌蛋白检测和LiPA基因分型对HPV16和HPV18型别的检测结果在两种标本中的一致性均较高(＞90％).E6癌蛋白检测对CIN2+的检出效果如下:在棉签标本中,其灵敏度50.0％、特异度93.9％、阳性预测值51.6％;而ThinPrep标本中,灵敏度46.9％、特异度97.1％、阳性预测值68.2％;两者ROC曲线下面积同样为0.72;各项指标间无统计学差异(P＞0.05).同样,对CIN3+的检出效果也相当,各指标间无统计学差异(P＞0.05).E6蛋白检测在不同检测条件下可重复性较好,且两种标本有其不同的优势,应当根据不同地区卫生资源,适当选择标本类型,进行宫颈癌筛查.