中国HIV-1 B’亚型毒株不同基因区与全长基因组系统进化比较

摘要:

本研究旨在探索不同基因区的使用对HIV-1B'亚型毒株系统进化分析结果的影响.首先利用既往研究中已发表的共计47条来自泰国,缅甸和中国多个地区不同传播途径的B’毒株近全长基因组序列,将其按基因区分为不同的数据集(gag,pol,vif,vpr,vpu,eni,nef),并分别进行系统进化分析研究.比较不同基因区系统进化分析的结果发现.B’亚型毒株pol基因在分析的基因区中,具有最低的复杂度和进化速率,可以较好的区分B'TH和B’YN毒株,重复近全长基因组序列的分析结果;尽管env基因则具有最高的复杂度和进化速率,但无法获得类似结果.本研究比较了不同基因区对HIV-1 B’亚型毒株系统进化分析结果的影响,对进一步开展HIV分子流行病学调查,分析我国B'毒株在我国的传播奠定了基础.

Abstract:

  • doi:
  • 关键词: HIV-1 B’亚型 pol基因 近全长基因组
  • Keyword:
  • 作者: 李喆 杨尧 魏静 冯毅 邢辉 何翔 邵一鸣
  • Author:
  • 作者单位:
  • 刊名: 病毒学报
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