中国HIV-1 B’亚型毒株不同基因区与全长基因组系统进化比较
摘要:
本研究旨在探索不同基因区的使用对HIV-1B'亚型毒株系统进化分析结果的影响.首先利用既往研究中已发表的共计47条来自泰国,缅甸和中国多个地区不同传播途径的B’毒株近全长基因组序列,将其按基因区分为不同的数据集(gag,pol,vif,vpr,vpu,eni,nef),并分别进行系统进化分析研究.比较不同基因区系统进化分析的结果发现.B’亚型毒株pol基因在分析的基因区中,具有最低的复杂度和进化速率,可以较好的区分B'TH和B’YN毒株,重复近全长基因组序列的分析结果;尽管env基因则具有最高的复杂度和进化速率,但无法获得类似结果.本研究比较了不同基因区对HIV-1 B’亚型毒株系统进化分析结果的影响,对进一步开展HIV分子流行病学调查,分析我国B'毒株在我国的传播奠定了基础.
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doi:
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关键词:
HIV-1 B’亚型
pol基因
近全长基因组
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Keyword:
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作者:
李喆
杨尧
魏静
冯毅
邢辉
何翔
邵一鸣
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Author:
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作者单位:
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刊名:
病毒学报
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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