基于SNP位点鉴定砂仁药材物种
摘要:
目的:为建立基于单核苷酸多态性(SNP)技术鉴别砂仁3个基原(阳春砂A momum villosum、海南砂A momum longiligulare、绿壳砂A momum villosum var. xanthioides)的方法,对这3个种共计60份材料ITS2序列进行分析比较。方法:将实验所得砂仁ITS2序列,应用CodonCode Aligner 软件进行序列拼接比对。用MEGA 5.0导出各序列变异位点,并对变异位点进行分析。为验证结果准确性,下载砂仁3个基原GenBank的所有ITS2序列,共计34条,对结果进行验证。结果:砂仁ITS2序列比对后长度为230 bp,3个不同基原在135 bp和199 bp处存在稳定SNP(s)变异位点。结论:本研究开发的两个稳定的SNP(s)位点可以快速准确地鉴定砂仁药材3个基原。
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doi:
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关键词:
砂仁
ITS2
SNP位点
鉴定
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Keyword:
Fructus Amomi
ITS2
SNPs
identification
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作者:
焦文静
张鹏
廖保生
王丽丽
韩建萍
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Author:
Jiao Wenjing
Zhang Peng
Liao Baosheng
Wang Lili
Han Jianping
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作者单位:
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刊名:
世界科学技术-中医药现代化
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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