创伤弧菌16S-23S rDNA间区变形梯度凝胶电泳多态性分析
摘要:
目的 建立创伤弧菌基因分型的新方法,了解创伤弧菌的分子特征.方法 应用PCR-变形梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对创伤弧菌的16S-23S rDNA间区(16S-23S rDNA intergenic spacer regions,ISR)多态性进行分析比较,结合药敏试验,以进一步验证分离菌株之间的亲缘关系.结果 ISR-PCR将创伤弧菌菌株扩增出4条约900、750、650、550 bp大小不同的条带;同时,创伤弧菌的ISR-DGGE序列表现出明显的株间差异,18株共产生了16种不同的指纹图谱;聚类分析将所有的细菌分为两大类,相似性分别为0.65和0.71;亲缘关系较近的菌株具有不同于关系较远的菌株的耐药谱,与ISR-DGGE指纹图谱分析相一致.结论 这种分子操作技术完全能够用于创伤弧菌株型的调查与鉴定,为创伤弧菌的基因分型提供了一种新的方法.
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doi:
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关键词:
创伤弧菌
16S-23S rDNA间区
PCR-变形梯度凝胶电脉
基因分型
致病菌
食品安全
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Keyword:
Vibrio vulnificus
16S-23 S rDNA intergenic spacer regions
PCR-DGGE
genotyping
pathogens
food safety
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作者:
张晶
周勇
陶霞
吴新伟
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Author:
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作者单位:
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刊名:
中国食品卫生杂志
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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