2017年辽宁省人感染汉坦病毒G2片段基因序列特征分析

摘要:

目的 了解2017年辽宁省肾综合征出血热(HFRS)患者感染汉坦病毒的(HV)的基因型别及变异情况.方法 采集HFRS患者急性期血清,采用酶联免疫吸附试验筛选IgM抗体阳性标本,从阳性标本全血中提取HV的RNA,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增G2基因片段并进行基因分型,对扩增产物进行核苷酸序列测定,利用DNAStar软件包分析.结果 10份标本经RT-PCR提取扩增出的目的片段,4份为汉滩型(HTN型),6份为汉城型(SEO型).扩增产物测序结果与已测得国内毒株及部分国际标准株比较,4份HTN型HV之间核苷酸同源性达到95.6% ~ 98,9%.与HTN76-118株同源性最高,为89.3%~90.1%,氨基酸同源性为98.4% ~ 99.2%.6份SEO型HV间核苷酸同源性高达98.3% ~ 99.8%.与80-39株同源性最高,为96.3% ~ 96.6%,推导氨基酸同源性为99.3% ~ 99.6%.结论 辽宁省是以SEO型HV为主的SEO型和HTN型混合型疫区,病毒G2基因片段间高度同源,无明显变异,遗传物质相对稳定.

Abstract:

  • doi:
  • 关键词: 汉坦病毒 G2片段 系统进化树 基因变异
  • Keyword:
  • 作者: 车雷 张国斌 高丹 赵梁 王晓丽
  • Author: Che Lei Zhang Guobin Gao Dan Zhao Liang Wang Xiaoli
  • 作者单位:
  • 刊名: 疾病监测
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