泉州地区2014-2017年活禽相关外环境禽流感病毒监测及遗传进化特征
摘要:
目的 分析泉州地区2014-2017年活禽相关外环境中H5、H7、H9亚型禽流感病毒的分布情况和分子生物学特点,为本地区人感染禽流感的防控和预警提供参考依据.方法 采集泉州地区活禽监测场所标本,采用实时荧光定量PCR方法检测甲型流感病毒以及H5、H7、H9亚型禽流感病毒,然后对检测结果进行统计学分析;并对4株代表性H7N9禽流感病毒毒株的HA和NA基因进行核苷酸序列测定和同源性分析,用DNAstar和MEGA7.0软件进行序列分析.结果 外环境标本甲型流感病毒核酸阳性率为29.04%(377/1289),其中H5、H7、H9亚型的阳性率分别为3.80% 、13.34% 、12.02%.各监测年份中,H7N9阳性率均高于其它亚型,其中2017年最高(21.88%).不同类型标本中,案板的H7N9阳性率最高(65.4%)、污水次之(59.3%)、禽类饮水最低(29.6%).采集场所中,最高的是农贸市场(61.7%)和活禽交易市场(52.8%).对4株H7N9病毒的HA和NA基因序列分析显示,外环境和人源病毒分别属于珠江三角洲和长江三角洲谱系.HA蛋白的裂解位点均为PKGR/G,没有发生高致病性突变;NA蛋白292位氨基酸都为R,没有出现奥司他韦耐药突变;PB2蛋白中,627位氨基酸从E突变为了K,526位和701位氨基酸没有出现突变.结论 泉州地区活禽相关外环境存在H7N9禽流感病毒污染,特别是农贸市场和活禽交易市场是人感染H7N9亚型的高风险场所,需要加强监测.
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doi:
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关键词:
禽流感病毒
H7N9
活禽相关外环境
监测
遗传进化特征
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Keyword:
Avian influenza virus ( AIV)
H7N9
Live poultry related external environment
surveillance
Phylogenetic characteristics
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作者:
郑友限
刘建忠
李锋平
陈志扬
陈明春
吴小凤
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Author:
Zheng Youxian
Liu Jianzhong
Li Fengping
Chen Zhiyang
Chen Mingchun
Wu Xiaofeng
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作者单位:
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刊名:
中华实验和临床病毒学杂志
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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