沈阳市鼠携带汉坦病毒G2片段基因分型及序列特征分析
摘要:
目的 了解沈阳市肾综合征出血热(HFRS)疫源地宿主动物携带汉坦病毒(HV)的基因型别及变异情况.方法 选取沈阳市HFRS高发地区,于2017年春、秋两季分别在居民区和野外同时捕获宿主动物(鼠),并采集鼠肺.采用间接免疫荧光试验(IFA)筛选出HV抗原阳性的鼠肺,用RT-PCR从IFA筛选阳性的鼠肺中扩增G2基因片段.经琼脂糖凝胶电泳进行基因分型,对扩增产物进行核苷酸序列测定,用DNAStar软件进行同源性分析.结果 筛选出HFRS抗原阳性的鼠肺17份,对阳性鼠肺标本经RT-PCR检测,10份标本扩增出目的片段,均为HV汉城型(SEO).扩增产物测序结果与国内毒株及部分国际标准株比较,10份SEO型HV之间核苷酸同源性高达99.3%~100%.与80-39株(韩国,1980)同源性最高,为95.6%~96.2%,推导氨基酸同源性为99.3%.结论 沈阳市HFRS鼠间疫情的HV基因型以SEO型为主,检测出的鼠间HV G2基因片段之间高度同源,无明显变异,遗传物质相对稳定.
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doi:
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关键词:
汉坦病毒
鼠肺
G2片段
系统进化树
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Keyword:
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作者:
车雷
张国斌
高丹
赵梁
王晓丽
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Author:
CHE Lei
ZHANG Guo-bin
GAO Dan
ZHAO Liang
WANG Xiao-li
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作者单位:
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刊名:
中国媒介生物学及控制杂志
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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