2013-2017年天津市柯萨奇病毒A6型分离株基因特征分析
摘要：
目的 分析天津市引起手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)的柯萨奇病毒A6型(Coxsackievirus A6,CV-A6) VP1区基因特征. 方法 收集2013-2017年分离自天津市HFMD患者的CV-A6毒株,采用RT-PCR扩增VP1区基因全长序列并测序,使用DNAStar 5.01软件进行同源性分析,使用MEGA 5.05软件进行基于VP1完整编码区的系统进化分析. 结果 38株CV-A6分离株之间的核苷酸及氨基酸同源性分别为87.4％～100.0％和93.3％～100.0％;系统进化分析显示,38株CV-A6均为D基因型,其中2013年2株为D2基因亚型,其余36株均为D3基因亚型.D3亚型又可分为D3a和D3b 2个进化分支,其中32株属于D3a分支,4株属于D3b分支. 结论 2013-2017年天津市致手足口病CV-A6流行株主要为D2和D3基因亚型,D3基因亚型又包括D3a和D3b两个进化分支,并以D3a进化分支为主,且呈隔年高发态势.
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doi：
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关键词：
手足口病
柯萨奇病毒A6型
系统进化分析
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Keyword：
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作者：
谭昭麟
吕莉琨
李力
庄志超
李佳萌
苏旭
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Author：
TAN Zhao-lin
LV Li-kun
LI Li
ZHUANG Zhi-chao
LI Jia-meng
SU Xu
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作者单位：
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刊名：
中国病原生物学杂志
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Journal：
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年，卷(期)：
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所属期刊栏目：
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基金项目
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在线出版日期：
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页码：