福建宋内志贺菌临床分离株MLVA分型的初步研究
摘要：
目的 评价多位点可变数目串联重复序列分析(multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis,MLVA)对福建地区宋内志贺菌的分型能力,为了解宋内志贺菌分子流行病学特征及疫情暴发时病原的溯源提供分析方法和基础数据. 方法 选择8个VNTR(Variable Number of Tandem Repeats)位点对68株临床分离株宋内志贺菌进行PCR扩增和毛细管电泳,利用BioNumerics软件进行聚类分析并构建最小生成树(Minimum spanning tree,MST),结合流行病学资料分析分型结果. 结果 68株宋内志贺菌经MLVA分型后遗传关联度在20.647％～100％之间,按照100％的相似水平可分为66个MLVA型,呈遗传多态性,分辨系数为0.9986;有6个优势基因群(G1～G6),表现出时间地区聚集性.在最小生成树中,芗城分离株显示不同程度的亲缘关系,形成本土流行的优势克隆群;新罗分离株来源分散,存在少数优势基因簇. 结论 福建临床分离株宋内志贺菌具有基因多态性,MLVA方法对该菌有较好的分型能力,可用于研究菌株间的亲缘关系.
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doi：
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关键词：
宋内志贺菌
MLVA
最小生成树
遗传进化
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Keyword：
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作者：
杨劲松
陈爱平
郑恩惠
罗朝晨
徐海滨
黄梦颖
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Author：
YANG Jin-song
CHEN Ai-ping
ZHENG En-hui
LUO Chao-chen
XU Hai-bin
HUANG Meng-ying
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作者单位：
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刊名：
中国病原生物学杂志
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Journal：
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年，卷(期)：
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所属期刊栏目：
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基金项目
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在线出版日期：
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