2012~2016年新疆柯萨奇病毒A6的分子流行病学特征分析

摘要:

分析新疆手足口病相关的柯萨奇病毒A6 (Coxsackievirus A6,CV-A6)毒株VP1区基因特征.2012~2016年从新疆手足口病病例标本中分离到75株CV-A6,对75株CV-A6采用RT-PCR方法扩增VP1区基因片段并进行核苷酸序列测定,应用MEGA5.05和BioEdit7.1.9软件进行核苷酸序列比对分析,构建系统进化树.75株新疆CV-A6毒株VP1区核苷酸序列同源性为86.9%~100%,与原型株(Gdula)同源性为81.4%~82.5%;71株D3亚型株与D3代表株之间核苷酸序列同源性为93.1%~99.6%;4株D2亚型株与D2代表株之间核苷酸序列同源性为92.6%~96.5%.进化树图分析显示,新疆CV-A6毒株均属于D基因型,其中绝大多数(71/75)处于D3分支,属于D3亚型,2012~2016年具有分布;少数(4/75)处于D2分支,属于D2亚型,只分离于2013~2014年.新疆CV-A6在系统进化树上形成多个不同的小分支,不同年份不同地区的CV-A6毒株分别与国内一些地区的毒株有着较近的亲缘关系,说明新疆CV-A6毒株的传播链和基因型分布与内地CV-A6相同,与内地的CV-A6共进化的.加强手足口病的病原学监测及相关病原的分子特征研究对手足口病的防控至关重要.

Abstract:

  • doi:
  • 关键词: 手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒A6 新疆维吾尔自治区
  • Keyword:
  • 作者: 邓红 冀天娇 黄永迪 韩桃利 张璇 宋欣欣 赵俊 阿依古丽·伊尔哈力 王凤英 岳锡宏
  • Author: DENG Hong JI Tianjiao HUANG Yongdi HAN Taoli ZHANG Xuan SONG Xinxin ZHAO Jun AYIGULI · Yierhali WANG Fengying YUE Xihong
  • 作者单位:
  • 刊名: 病毒学报
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