中国六省市12例水痘-带状疱疹患者病毒糖蛋白E基因的序列特征分析
摘要：
为了解我国流行的水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)的主要中和抗原糖蛋白E(GlycoproteinE,gE)的基因特征,选取2007～2015年在北京(1例)、上海(5例)、吉林(2例)、青海(1例)、广东(2例)、四川(1例)等六个省市收集到的VZV疑似感染者的疱疹液或咽拭子标本共12份.提取样本DNA,采用PCR扩增病毒基因组ORF22的特异片段筛选阳性样本并鉴定基因型别.用PCR扩增VZV阳性样本及国产水痘减毒活疫苗(vO-ka-BK)和进口水痘减毒活疫苗(VarilRix-1)的gE基因序列片段,进行核苷酸序列测定和分析.采用BioEdit、MEGA 5.0软件,将本次所测VZV阳性样本的gE基因序列与GenBank数据库中VZV所有基因型野毒株及疫苗株的gE序列进行对比分析.结果表明,12份VZV标本均为阳性样本,且均为Clade 2基因型.本次所测所有样本仅在115 926位点上存在C119T的碱基突变,并导致第40位氨基酸从苏氨酸突变为异亮氨酸(T40I),但此突变也发生在已报道的所有疫苗株及除了Clade 1外的其它基因型野毒株中,这个突变并没有基因型别以及毒力特异性.对GenBank数据库中VZV毒株的gE进行对比分析,发现除115 926位点外,所有Clade 5型野毒株在116 869位点均存在T→G的同义突变;所有疫苗株中,1 002/2 008株在117 566位上还存在G1759A的碱基突变,从而导致第587位氨基酸从缬氨酸变为蛋氨酸(V587M).本研究发现VZV的gE基因高度保守、抗原性稳定,丰富了我国VZV gE糖蛋白基因的本底资料,为后续VZV的相关基础研究与疫苗的研发及效果评估提供了基础数据.
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doi：
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关键词：
水痘-带状疱疹病毒(VZV)
糖蛋白
水痘疫苗
基因特征
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Keyword：
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作者：
吴秋华
许松涛
齐梦缘
牟君杰
李崇山
陈萌
周剑慧
郑焕英
何吉兰
许文波
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Author：
WU Qiuhua
XU Songtao
QI Mengyuan
MOU Junjie
LI Chongshan
CHEN Meng
ZHOU Jianhui
ZHENG Huanying
HE Jilan
XU Wenbo
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作者单位：
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刊名：
病毒学报
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Journal：
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年，卷(期)：
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所属期刊栏目：
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基金项目
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在线出版日期：
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页码：