基于纳升高效液相色谱-四极杆-线性离子阱-静电场轨道阱高分辨质谱技术研究广地龙中的蛋白质
摘要:
该文以新鲜广地龙(来源钜蚓科动物参环毛蚓Pheretima aspergillum)为研究对象,采用SDS-PAGE法对广地龙总蛋白进行分离,并进行胶内酶切,利用纳升高效液相色谱-四极杆-线性离子阱-静电场轨道阱高分辨质谱技术研究广地龙中的蛋白质.采用Proteome Discoverer软件,检索环节动物门蛋白数据库(Annelida.fasta)鉴定蛋白.结果共鉴定到386个蛋白质,包括珠蛋白、甘油醛-3-磷酸脱氢酶、纤溶活性蛋白等,大多数蛋白质与细胞结构、能量供给有关,纤溶活性蛋白、胍乙基磷酸丝氨酸蛋白酶可能与抗凝血或溶栓活性有关.利用PANTHER对蛋白进行基因本体功能分类,KEGG进行代谢通路富集分析,发现涉及多种信号转导通路,包括代谢途径、碳代谢通路,氨基酸的生物合成通路,糖酵解/糖异生通路,柠檬酸循环等54种.该研究为阐明广地龙的蛋白物质基础以及其功能研究提供了实验依据.
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doi:
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关键词:
广地龙
蛋白质
SDS-PAGE
orbitrap fusion lumos
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Keyword:
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作者:
董洪霜
张静娴
胡青
王艳春
孙健
张甦
于泓
冯睿
毛秀红
季申
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Author:
DONG Hong-shuang
ZHANG Jing-xian
HU Qing
WANG Yan-chun
SUN Jian
ZHANG Su
YU Hong
FENG Rui
MAO Xiu-hong
JI Shen
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作者单位:
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刊名:
中国中药杂志
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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