猪链球菌wzy基因与血清型别的相关性分析

摘要:

目的 分析wzy基因序列与血清分型相关性,评价基于wzy基因的基因组水平血清分型的可行性.方法 建立了33个已知血清型(1 ~31,33与1/2型)及21种新型cps型别(NCL1 ~ 20与Chz型)的wzy基因的氨基酸序列数据库,用来检索公开发表的767个有传统血清分型结果的基因组序列,以确定它们的分子血清型别,并与其用传统血清分型结果进行比对.结果 767个基因组中,有765个基因组含有1种且仅含有1种数据库中的wzy基因,剩余的2个基因组携带数据库中没有的wzy基因,本研究中将其cps型别命名为NCL21.94.13% (722/767)基因组的分子血清型别与其传统血清分型结果一致.在二者结果有差异的基因组中,其cps基因簇的核苷酸序列与其传统血清分型结果相应的血清型标准菌株cps序列有明显的差异.结论 基因组水平检测血清型特异性的wzy基因的分型策略,显著优于传统的血清分型方法.

Abstract:

  • doi:
  • 关键词: 猪链球菌 wzy基因 基因组 血清分型
  • Keyword:
  • 作者: 王建平 杜鹏程 白雪梅 郑翰
  • Author: Wang Jianping Du Pengcheng Bai Xuemei Zheng Han
  • 作者单位:
  • 刊名: 疾病监测
  • Journal:
  • 年,卷(期):
  • 所属期刊栏目:
  • 基金项目
  • 在线出版日期:
  • 页码:
相同研究主题
相关论文(与本文研究主题相同或者相近的论文)
Copyright © 2014-2019 晟斯医学 All Rights Reserved. 备案号:苏ICP备11037034号-5 版权所有:南京孜文信息咨询有限公司