猪链球菌wzy基因与血清型别的相关性分析
摘要:
目的 分析wzy基因序列与血清分型相关性,评价基于wzy基因的基因组水平血清分型的可行性.方法 建立了33个已知血清型(1 ~31,33与1/2型)及21种新型cps型别(NCL1 ~ 20与Chz型)的wzy基因的氨基酸序列数据库,用来检索公开发表的767个有传统血清分型结果的基因组序列,以确定它们的分子血清型别,并与其用传统血清分型结果进行比对.结果 767个基因组中,有765个基因组含有1种且仅含有1种数据库中的wzy基因,剩余的2个基因组携带数据库中没有的wzy基因,本研究中将其cps型别命名为NCL21.94.13% (722/767)基因组的分子血清型别与其传统血清分型结果一致.在二者结果有差异的基因组中,其cps基因簇的核苷酸序列与其传统血清分型结果相应的血清型标准菌株cps序列有明显的差异.结论 基因组水平检测血清型特异性的wzy基因的分型策略,显著优于传统的血清分型方法.
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doi:
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关键词:
猪链球菌
wzy基因
基因组
血清分型
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Keyword:
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作者:
王建平
杜鹏程
白雪梅
郑翰
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Author:
Wang Jianping
Du Pengcheng
Bai Xuemei
Zheng Han
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作者单位:
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刊名:
疾病监测
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Journal:
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年,卷(期):
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所属期刊栏目:
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基金项目
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在线出版日期:
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