巢式PCR的优缺点及注意事项

2018.11.05 15:07
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巢式PCR的优点:

  1、克服了单次扩增平台期效应的限制,使扩增倍数提高,从而极大的提高了PCR的敏感性;

  2、由于模板和引物的改变,降低了非特异性反应连续放大进行的可能性,保证了反应的特异性;

  3、内侧引物扩增的模板是外侧引物扩增的产物,第二阶段反应能否进行,也是对第一阶段反应正确性的鉴定,因引可以保证整个反应的准确性及可行性。

  巢式PCR的缺点:

  1、进行第二次PCR坟增引起交叉污染的几率大。为了克服此缺点,可彩用同一反应管中巢式PCR,主要利用内外引物Tm值不同。

  2、如果你已排除引物,酶,RNA提取,逆转录等等其他原因引起的PCR不成功,确定关键原因是模板量低的话,可以用巢式。

巢式PCR.png

  巢式 PCR 注意事项

  1、如果要提高扩增效果,具备回收的条件的话,回收后继续第二次 PCR是没有问题的。如果不具备回收条件,不回收直接稀释后进行二次 PCR也可, 因为内引物同样具有相当的特异性,如果设计合理,第一次非特异性的扩增产物为模板,不能和第二对引物有效结合,这样的非特异产物的模板不能在第二次扩增中产生目的条带。

  2、在第一轮PCR结束之后,将PCR产物稀释1 000倍(视情况而定)作为第二轮PCR的模板,第二轮PCR的产物同样稀释1 000倍(视情况而定)作为第三轮PCR的模板,这样依次类推。实际操作中可以搞3轮甚至更多,当然做3轮是比较合适了,这个时候PCR的产物已经是高度特异性了。


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